nbp: (Default)
[personal profile] nbp
Ну, что?
Все мы произошли от синильной кислоты?

http://www.nature.com/nchem/journal/vaop/ncurrent/full/nchem.2202.html

Date: 2015-03-18 02:13 pm (UTC)
From: [identity profile] nick-k56.livejournal.com
где ж ее столько взять?

Date: 2015-03-19 10:43 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
А много и не надо, достаточно каждой молекулы по одной. На начальном этапе.

Date: 2015-03-19 10:44 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
А много и не надо, достаточно каждой молекулы по одной. На начальном этапе.

Date: 2015-03-19 11:32 am (UTC)
From: [identity profile] nick-k56.livejournal.com
ну с одной как-то совсем венчурно

Date: 2015-03-19 11:41 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
так это основной принцип - сколько бы их там ни было, а выжившее - потомство именно одной молекулы.

Date: 2015-03-19 12:44 pm (UTC)
From: [identity profile] nick-k56.livejournal.com
так-то оно так, но сколько тех молекул в клетку собраться должно, да еще в разные функционирующие системы. учитывая конечность времени жизни этих молекул, то из одной вряд ли что получится.

Date: 2015-03-19 01:33 pm (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
Конечно. И чем больше популяция, тем больше вероятность, что что-то более сложное из них получится. Но достаточно одного такого случая - на каждом этапе усложнения.

Date: 2015-03-18 03:43 pm (UTC)
From: [identity profile] myugor.livejournal.com
Да, да, из циановодорода, да еще с добавкой сероводорода и следами меди!
Где ж было в те тяжелые времена достать что-то более вкусное?
Edited Date: 2015-03-18 03:44 pm (UTC)

Date: 2015-03-19 10:48 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
И так наша праматерь Синильная Кислота обменялась с праотцом нашим Сероводородом медным колечком.

Но мы, их правнуки, что-то им не нравимся, они нас убивают при встрече....

Date: 2015-03-18 05:36 pm (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
Ну так оно еще в двутомной "Органике" Несмеяновых изложено: аденин пентамеризацией синильной кислоты, углеводы (тема которых в данном случае не раскрыта) - полимеризацией формальдегида по Бутлерову - и понеслось-поехало.

Кстати, креационистов, глубокомысленно рассуждающих об исчезающе малой вероятности образования полимерных молекул, нужно отдавать на растерзание химикам синтетикам. В те частые периоды, когда вместо тщательно задуманного синтеза прелести идет осмоление.

Date: 2015-03-19 06:07 am (UTC)
From: [identity profile] nick-k56.livejournal.com
ну тут немножко сложней - нужно не только синтезировать, но и запустить механизм самовоспроизводства

Date: 2015-03-19 08:48 am (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
И обсуждаемая статья, и Несмеяновы - это о совсем ранних стадиях абиогенеза: именно об абиогенном синтезе (пре)биоорганики. Максимум, что здесь можно рассматривать - это автокаталитические реакции (в т.ч. сопряженные), которые самовоспроизводством можно назвать, но с большой натяжкой.
IMHO "настоящее" самовоспроизводство появляется с возникновением компартментализации и, соответственно, метаболизма (в IUPACовском смысле :) ).
Но это уже другой вопрос.

Date: 2015-03-19 10:57 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
На стерильной планете можно было долго и медленно заквашиваться в примитивных формах и без компартментализации.

Date: 2015-03-19 04:32 pm (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
Без компартментализации нет организма. А единица отбора - именно организм.
Кроме того, проблема концентраций и энтропии разбавления: при малых концентрациях скорости реакций субстрата с растворителем начинают превышать скорости реакций друг с другом.

Date: 2015-03-19 04:56 pm (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
До образования организма единица отбора - молекула.

"проблема концентраций и энтропии разбавления":
Вообще же здесь проблема несколько философского плана, мы требуем от происхождения жизни некоего соответствия нормальным физико-химическим законам. Но это только желательно, но не обязательно, ибо речь идет о уникальном событии.

Date: 2015-03-20 09:30 am (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
> До образования организма единица отбора - молекула.
Не, до образования организма единица отбора - реакция. IMO.
Или даже каскад сопряженных реакций, если задумываться о преметаболизме.

> мы требуем от происхождения жизни некоего соответствия нормальным физико-химическим законам.
Не понял о нормальности физхимии. Или имелось в виду, что под жизнью понимаем химию только растворов?

Date: 2015-03-20 10:43 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
"единица отбора - реакция" - не совсем правильно так заявлять, говоря о полимерах. Просто идет отбор тех или иных структур, поэтому единица отбора - молекула.
Хотя, собственно говоря, можно посмотреть под тем же углом и на организменную селекцию - при этом просто геномы инкапсулированы.

" о нормальности физхимии" - да, я тут неудачно выразился. Речь идет о том, что энтропия не обязана расти - система-то открытая... но для меня это зыбкая почва....

Date: 2015-03-19 11:39 am (UTC)
From: [identity profile] nick-k56.livejournal.com
ну да. только как? ну так чтоб без креационизма, панспермии или просто е....ой матери? и чтоб вероятность была и наследственность?
Edited Date: 2015-03-19 11:41 am (UTC)

Date: 2015-03-19 11:48 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
А вот никак. Могло ничего и не получиться. В точности же никогда и не узнать, как именно это было.
Но пофантазировать и поэкспериментировать на эту тему - ужасно интересно.
Что касается панспермии, то ничего против ее не имею, но она ничего не меняет - не на Земле, так где-то там на Совсем Другой Планете однажды это случилось...

Date: 2015-03-19 11:57 am (UTC)
From: [identity profile] nick-k56.livejournal.com
+ расширение пространства и времени=>рост вероятности
ну или креационизм

Date: 2015-03-19 12:07 pm (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
Вот в космологии ничего не понимаю... наверное, так...

Date: 2015-03-19 12:26 pm (UTC)
From: [identity profile] nick-k56.livejournal.com
ну просто пробирка расширяется до гигантских/бесконечных размеров и во времени нет ограничения. да еще спектр условий расширяется. где-нибудь, да срастется... Кажется, Крик про это еще писал...

Date: 2015-03-19 04:33 pm (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
Панспермия - это как перебрасывание мусора за чужой забор.
Проблема первоначального - не важно где - происхождения жизни ведь остается.

Date: 2015-03-19 04:27 pm (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
Непонятно.

Без компартментализации - это модель "мира РНК".
РНК каталитична и активность рибозимов разнообразна.
Т.е авторепликация рибозимов, известна и продемонстрирована, включая их эволюцию in vitro - из свежего и красивого см. Robertson, Michael P., Gerald F. Joyce. «Highly Efficient Self-Replicating RNA Enzymes». Chemistry & Biology 21, вып. 2 (2014 г.) doi:10.1016/j.chembiol.2013.12.004.

Но уже на этом уровне есть грабли - трифосфатный, т.е. активированный субстрат, который сам по себе и в случае сложившейся жизни появляется на выходе дыхательных цепей.

Есть, конечно, экспериментальные модели фотохимического синтеза АТФ из монофосфата, но там желательно присутствие некоего УФ-акцептора, который передает возбужнение на цель - Kritsky, M. S. et al. «Modeling of Abiogenic Synthesis of ATP». Doklady Biochemistry and Biophysics 417, вып. 1 (1 декабрь 2007 г.): 313–15. doi:10.1134/S1607672907060063.

Остаются проблемы концентраций, но не-помню-кто предложил сорбционную модель, где органика из раствора сорбируется на минеральной поверхности (типа недовыветренных глин). Красота этой модели - это то, что она не только обеспечивает повышение концентраций, но и дополнительный катализ - на поверхности торчат ионы тяжелых металлов, которые могут координироваться с азотами-кислородами субстрата и/или обеспечивать суперкислотный катализ. Дополнительный бонус - темплатный синтез на металлических центрах всякой прелести вроде порфиринов.

Т.е. вроде бы до этого уровня все складывается.

Но вот как дальше сюда пристегиваются аминокислоты/белки (нерибосомный синтез пептидов известен - этим до сих пор занимаются цианобактерии) и каким образом из всего этого дела выстраиваются рибосомы... Вот в чем вопрос.
Edited Date: 2015-03-19 04:28 pm (UTC)

Date: 2015-03-19 05:02 pm (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
Так проблем куча, кто ж спорит, очень много темных мест.
Но могли существовать некие псевдокомпартменты на всяких пористых глинах с иммобилизацией полимеров и затрудненной диффузией мономеров.
Другая очень замечательная вещь - циклы высыхания-размачивания, при этом достигаются высокие концентрации и идут самые удивительные процессы.

Date: 2015-03-19 10:56 am (UTC)
From: [identity profile] nibope.livejournal.com
Да, это развитие уже не новой идеи. Но довольно важное.

Profile

nbp: (Default)
nbp

December 2016

S M T W T F S
     1 2 3
4 5 6 7 8 9 10
11 12 13 14 151617
18 19 20 21 22 23 24
25 2627 28 293031

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jul. 25th, 2025 05:29 pm
Powered by Dreamwidth Studios